プログラム gpuautodock.sf.net
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AutoDock Software in Parallel with GPUs 無料
CUDA API を使用して、このプロジェクトは、NVIDIA GPU で並列実行するように AutoDock ソフトウェアを変更します。ユーザーは、コードをダウンロードしてコンパイルし、CUDA対応グラフィックスカードでAutoDockを使用することができます。オートドックはhttp://autodock.scripps.edu/