ニューロコンストラクトは、UCLの神経科学・生理学・薬理学科のシルバーラボで開発されています。neuroConstructは、生物学的に現実的なニューロン、すなわち樹状形態と現実的な細胞膜伝導を組み込んだモデルの複雑なネットワークの開発を簡素化するように設計されています。これはJavaで実装され、開発の高度な段階で他のシミュレーションプラットフォーム(PSICS、MOOSEおよびPyNNを含む)をサポートして、ニューロンとジェネシスシミュレータ用のスクリプトファイルを生成します。これは、モーフML、チャンネルMLとネットワークMLを含む最新のNeuroML仕様を使用しています。 このソフトウェアの開発は、ウェルカムトラスト、医学研究評議会とEUシナプスプロジェクトからの資金で可能になりました。 neuroConstruct の主な機能の一部を次に示します。 *neuroConstructは、単一の細胞またはネットワークモデルに含まれる遺伝子、ニューロン、神経ルカルシダ、SWCおよびMorphML形式の形態ファイルをインポートすることができ、またはより抽象的な細胞も手動で構築することができます。 *3Dに位置するコンダクタンスベースのニューロンのネットワークの作成 * ネットワークに対してセルグループ間の複雑な接続パターンを指定できます。 *シミュレーションスクリプトは、ニューロン、ジェネシス、MOOSE、PSICSおよびPyNNベースのシミュレータ用に生成することができます(注:すべてのプロジェクトをすべてのシミュレータに生成できるわけではありません) *生物物理学的に現実的な細胞メカニズム(シナプス/チャネルメカニズム)は、ネイティブスクリプトファイル(*.modまたは*.g)からインポートするか、ChannelMLを使用してテンプレートから作成することができます * シミュレーションデータを記録するコードの自動生成とneuroConstructデータの視覚化/分析 *記録されたシミュレーションの実行は、シミュレーションブラウザのインタフェースを介して表示および管理することができます * Python ベースのスクリプトインターフェイスを使用して、モデルの生成と実行を制御できるため、セルとネットワーク モデルの最適化のために複数のシミュレーションを実行できます。
バージョン履歴
- バージョン 1.6.0 に転記 2012-08-23
プログラムの詳細
- カテゴリ: 教育 > 科学
- パブリッシャー: University College London
- ライセンス: 無料
- 価格: N/A
- バージョン: 1.6.0
- プラットフォーム: windows