NDKmol - molecular viewer 0.97

ライセンス: 無料 ‎ファイルサイズ: 688.13 KB
‎ユーザー評価: 3.0/5 - ‎1 ‎投票

NDKmol -- アンドロイドのための分子ビューア == 約 == NDKmolはアンドロイドのための分子ビューアです。タンパク質、核酸、小分子の3次元構造を見ることができます。NDKmolは、リボン、トレース、スティック、球、線などの分子の一般的な表現のほとんどをサポートしています。NDKmolはまた対称性操作をサポートする;生物アセンブリおよび水晶のパッキングは表示することができる。RCSB PDB および NCBI パブケムから構造を検索してダウンロードできます。 NDKmolは、GLmolとほとんど同じ機能を持っています。 WebGL/Javaスクリプトは、Webブラウザ上で実行されます。あなたはhttp://webglmol.sourceforge.jp/index-en.htmlでGLmolを試すことができます == 機能 == * PDB または SDF/MOL ファイルを読み取る *指で回転/翻訳/ズームモデル *表現 - ライン - スティック - スフィア(ファンデルワールス半径) - アルファカーボントレース - リボン(薄いまたは厚い) - ストランド - Bファクターチューブ - 核酸ラダー - 核酸ライン - 溶剤'星' *ベータシートのスムージング *着色 - チェーン別 - 二次構造別(SHEET/HELIX レコードで定義されている場合) - 要素別 - グラデーション(別名チェーンボウ) - B因子 - 極/非極性 *結晶学 - 表示単位セル - クリスタルパッキングを表示する(REMARKセクションで定義されている場合) - 生物学的アセンブリを表示する(REMARKセクションで定義されている場合) == 使用方法 == 起動すると、NDKmolは、例として自動的にポリン(PDBID:2POR)をロードします。指で分子を回転させることができます。 分子をズームまたは移動するには、携帯電話/タブレットでMENUボタンを押してモードを選択します。2 本指ジェスチャもサポートされています。 その他はすべて MENU から実行できます。 他のPDBファイルをロードするには、SDカードの「PDB」ディレクトリにファイルを入れて、MENUで「開く」コマンドを選択してください。また、RCSB PDB および NCBI パブケム Web サーバーから直接構造をダウンロードすることもできます。メニューの「検索とダウンロード」を選択します。 == 連絡先 == プロジェクトのウェブサイトはhttp://webglmol.sourceforge.jp/にあります。このプログラムのソースコードはここから入手できます。 コメントや提案は、http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/または[email protected]で歓迎されています === ライセンス通知 === NDKmol自体は、以下のようにGNUより少ない一般公衆ライセンスの下でライセンスされています. ただし、例として含まれている PDB ファイルは、異なる条件下にあります。 ご相談ください http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - アンドロイドのための分子ビューア (C) 著作権 2011, biochem_fan このプログラムはフリーソフトウェアです:あなたはそれを再配布したり、変更することができます によって公開されたGNUより少ない一般公衆ライセンスの条件の下で フリーソフトウェア財団、ライセンスのバージョン3、または (あなたのオプションで)後のバージョン。 このプログラムは、それが有用であることを期待して配布され、 しかし、任意の保証なし。の黙示的保証さえせずに 特定の目的に対する商品性または適合性。を参照してください。 詳細については、GNUより少ない一般公衆ライセンス。 あなたはGNUより少ない一般公衆ライセンスのコピーを受け取るべきでした

バージョン履歴

  • バージョン 0.97 に転記 2018-03-25
    RCSB PDB からの PDB ダウンロードを修正しました
  • バージョン 0.95 に転記 2015-05-02
    バージョン 0.95 (20150503),* 最近のサーバーアップデートで動作するように固定 "Search PubChem" * うまくいけば、このバージョンはAndroid 5で動作するはずです。(ネクサス7でAndroid 5.1でテスト)、そうでなければ、私に詳細を送ってください.、*MRCマップファイル(ベータ)を開くことができます、MENUボタンなしでデバイスのユーザーに:、たとえば、長いホームボタンを押して、MENUを開く方法があるはずです。お使いのデバイスのマニュアルを参照してください。
  • バージョン 0.92 に転記 2013-07-02
    いくつかの修正と更新

プログラムの詳細