RasMol 2.7.5
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に関しては RasMol
ソースフォージOpenRasMolプロジェクトは、http://rasmol.orgのラスモルとオープンラスモールプロジェクトの補助的なプロジェクトです。SourceForge OpenRasMolプロジェクトは、積極的な共同貢献のための便利な焦点を提供することが期待されています。 ラスモルの特徴: RasMolは、タンパク質、核酸および小分子の視覚化を目的とした分子グラフィックスプログラムです。このプログラムは、出版品質の画像の表示、教育、生成を目的としています。RasMolは、マイクロソフトのWindows、アップルマッキントッシュ、UNIX、VMSシステムを含む幅広いアーキテクチャとオペレーティングシステム上で動作します。UNIX および VMS バージョンには、8 ビット、24、または 32 ビットカラーの X Windows ディスプレイ (X11R4 以降) が必要です。RasMol の X Windows バージョンは、ハードウェア ダイヤル ボックスと高速の共有メモリ通信 (XInput および MIT-SHM 拡張機能を介して) 現在の X Server で利用可能な場合、オプションでサポートを提供します。 プログラムは分子座標ファイルを読み込み、インタラクティブに色のスキームや分子表現の様々な画面上の分子を表示します。現在利用可能な表現には、深度キュードワイヤーフレーム、「ドライディング」スティック、スペースフィル(CPK)球、ボールとスティック、固体およびストランド生体分子リボン、原子ラベルおよびドット表面が含まれます。 RasMol の X Windows バージョンは、ハードウェア ダイヤル ボックスと高速の共有メモリ通信 (XInput および MIT-SHM 拡張機能を介して) 現在の X Server で利用可能な場合、オプションでサポートを提供します。 プログラムは分子座標ファイルを読み込み、インタラクティブに様々な表現やカラースキームで画面上の分子を表示します。サポートされる入力ファイル形式は、タンパク質データバンク(PDB)、トリポスアソシエイツの錬金術およびSybyl Mol2フォーマット、分子デザインリミテッド(MDL)モルファイル形式、ミネソタスーパーコンピュータセンター(MSC)XYZ(XMol)フォーマット、CHARMmフォーマット、CIF形式およびmmCIFフォーマットファイルが含まれます。接続情報がファイルに含まれていない場合、これは自動的に計算されます。ロードされた分子は、ワイヤフレーム結合、シリンダー'ドライディング'スティックボンド、アルファカーボントレース、スペース充填(CPK)球、高分子リボン(滑らかなシェーディングされた固体リボンまたは平行ストランドのいずれか)、水素結合およびドット表面表現として示すことができる。原子は任意のテキスト文字列でラベル付けすることもできます。代替適合者および複数のNMRモデルは、特別に着色され、原子ラベルで識別することができる。分子の異なる部分は、分子の残りの部分とは無関係に表現および着色されるか、または同時に複数の表現で表示され得る。表示された分子は、マウス、スクロールバー、コマンドライン、または付属のダイヤルボックスを使用してインタラクティブに回転、変換、ズーム、およびZクリップ(スラブ)することができます。RasMol は、スクリプトファイルから (またはプロセス間通信を介して) コマンドの準備されたリストを読み取って、特定の画像または視点を素早く復元することができます。また、現在のイメージを再生成するために必要なコマンドを含むスクリプト ファイルを作成することもできます。最後に、レンダリングされたイメージは、ラスターまたはベクトルのPostScript、GIF、PPM、BMP、PICT、Sunラスタファイル、またはMolScript入力スクリプトまたはKinemageなどのさまざまな形式で書き出すことができます。 RasMol ヘルプ機能には、「ヘルプ」または「ヘルプ」と入力してアクセスできます。